- Pleiocraterium gentianifolia
- Pleiogynium timoriense
- Poikilogyne villosa
- Polyalthia insignis
- Polyosma verticillata
- Polyscias mollis
- Prainea scandens
- Praravinia suberosa
- Praravinia verruculosa
- Psychotria myrmecophila
- Ptychopyxis caput-medusae
- Ptychopyxis costata
- Ptychopyxis grandis
- Quassia indica
- Reinwardtiodendron celebicum
- Reinwardtiodendron humile
- Remirea maritima
- Rhododendron caespitosum
- Rhododendron saxifragoides
- Rinorea anguifera
- Rinorea javanica
- Ryparosa calotricha
- Ryparosa fasciculata
- Ryparosa hullettii
- Salacia macrophylla
- Salacia papuana
- Salvia scapiformis
- Samanea saman
- Sarcotheca ochracea
- Saurauia myrmecoidea
- Sauropus androgynus
- Sauropus bacciformis
- Scaevola oppositifolia
- Scaevola verticillata
- Schismaglottis bulbifera
- Schizomeria serrata
- Secamone elliptica
- Semecarpus aruensis
- Semecarpus bunburyanus
- Sericolea micans
- Shirakopsis indica
- Shorea acuminata
- Shorea peltata
- Smilax borneensis
- Spiraeopsis brassii
- Stemonurus monticolus
- Stephania venosa
- Sterculia laurifolia
- Streblus taxoides
- Syzygium vernicosum